Setelah Kekaisaran tumbang, sisa-sisa pasukannya masih menyebarkan ancaman di seluruh galaksi. Demi menjaga perdamaian, Republik Baru meminta bantuan pemburu bayaran legendaris Din Djarin dan murid mudanya, Grogu, untuk menghadapi bahaya yang terus mengintai.
Teks pembuka menjelaskan runtuhnya Galactic Empire dan lahirnya New Republic. Namun meski Kekaisaran sudah jatuh, masih banyak kriminal di galaksi yang setia pada sisa-sisa kekuatannya. Karena itu, New Republic meminta bantuan pemburu bayaran Din Djarin, yang dikenal sebagai The Mandalorian atau Mando, bersama murid kecilnya, Grogu.
Film dimulai saat sekelompok loyalis Kekaisaran mengadakan pertemuan yang dipimpin Commander Barro. Ia memberi tahu para bawahannya bahwa upeti mereka akan dinaikkan demi menjamin perlindungan. Ketika salah satu orang berani mempertanyakannya, Barro langsung membunuhnya.
Pertemuan itu kemudian diganggu oleh kedatangan Din Djarin. Mando menghabisi para penjaga dan mengejar Barro. Grogu ikut membantu saat mereka melompat ke sebuah walker dan menerobos medan bersalju, sementara Barro dan pasukan AT-AT-nya menembaki mereka. Djarin berhasil mengalahkan anak buah Barro, lalu membuat kapal Barro jatuh bersama Barro di dalamnya. Setelah itu, Djarin dan Grogu bergabung dengan rekan mereka, Zeb, untuk kabur.
Djarin dan Grogu kemudian melapor kepada Colonel Ward, salah satu pemimpin New Republic. Ward tidak senang karena Djarin membuat Barro tewas. Padahal ia berharap bisa mendapatkan informasi dari Barro untuk mencegah perang baru dengan sisa-sisa Kekaisaran.
Ward lalu memberikan Djarin kapal Razor Crest yang baru untuk menjalankan misi berikutnya: mencari seorang buronan bernama Commander Coin. Ward meminta Djarin pergi ke Nal Hutta dan menemui Hutt Twins untuk mencari informasi tentang keberadaan Coin. Namun sebelum memberi informasi, Hutt Twins meminta Djarin menemukan keponakan mereka yang hilang, Rotta, putra Jabba yang terkenal kejam.
Djarin dan Grogu pergi ke Nal Hutta. Dari Hutt Twins, mereka mengetahui bahwa Rotta berada di planet Shakari. Di sana, Mando membayar seorang penjual makanan bernama Hugo untuk mencari informasi. Ia kemudian tahu bahwa Rotta ternyata menjadi gladiator populer di arena.
Djarin dan Grogu menyaksikan salah satu pertarungan Rotta, lalu pergi ke selnya untuk membebaskannya. Namun Rotta menolak dianggap sebagai tahanan. Ia memang ingin bertarung, karena ingin dikenal bukan hanya sebagai anak Jabba. Rotta juga mengaku masih memiliki utang kepada seseorang bernama Lord Janu sebelum bisa benar-benar bebas. Meski begitu, Rotta bersikap baik kepada Grogu dan tetap menolak diselamatkan.
Mando lalu kembali mencari Hugo untuk mengetahui keberadaan Janu.
Djarin membawa Grogu ke sebuah bar kumuh. Di sana, ia menginterogasi preman bernama Hogsbreth untuk mencari Janu. Para preman lain menyerangnya, tetapi Mando mampu melawan mereka semua. Ia bahkan memotong tanduk Hogsbreth sebelum Janu muncul.
Saat Djarin menjelaskan misinya, Janu mengungkapkan bahwa ia sudah merencanakan kematian Rotta di arena. Caranya, ia akan terus mengirim banyak petarung sampai Rotta tidak mampu bertahan lagi. Janu bahkan menawarkan Djarin untuk ikut bertarung sebagai gladiator.
Djarin dan Grogu kembali ke sel Rotta untuk memperingatkannya bahwa ia sedang ditandai untuk dibunuh. Namun Rotta tidak ingin kembali ke bibi dan pamannya, karena mereka sebenarnya ingin membunuhnya juga. Sebagai pewaris takhta Jabba, Rotta dianggap penghalang, meski ia sendiri tidak tertarik pada kekuasaan itu.
Rotta kemudian memanggil penjaga dan menjebak Djarin. Mando terkena gas, tetapi sebelum pingsan, ia masih sempat menyuruh Grogu pergi.
Djarin terbangun di arena. Ia dipaksa bertarung melawan Rotta. Mando mencoba berbicara baik-baik, tetapi Rotta tetap menyerangnya. Djarin akhirnya berhasil melucuti Rotta, tetapi ia menolak membunuhnya.
Janu lalu mengirim para petarung lain untuk menyerang mereka berdua. Djarin dan Rotta terpaksa bekerja sama melawan para monster. Mereka kemudian menghancurkan penghalang arena, membuat para monster menyerang dan memakan para penonton. Di tengah kekacauan itu, mereka berhasil kabur. Namun Rotta kembali melarikan diri agar tidak dikirim ke Nal Hutta.
Djarin dan Grogu mengejarnya. Dengan bantuan Zeb, mereka berhasil menghentikan dan menangkap Rotta.
Dalam perjalanan kembali ke Nal Hutta, Rotta mengungkapkan bahwa Janu dan Coin adalah orang yang sama: Commander Janu Coin. Bersama Zeb, Djarin dan Grogu menyusup ke markas Coin dan berhasil menangkapnya. Anak buah Coin mengejar mereka, sementara Grogu berusaha membantu meski usahanya tidak terlalu berhasil. Pada akhirnya, mereka tetap bisa kabur.
Djarin membawa Coin kepada Ward. Ward tidak senang karena Djarin tidak membawa Rotta kembali. Namun Mando mengatakan bahwa Coin akan memberikan semua informasi yang dibutuhkan Ward. Setelah itu, Djarin dan Grogu menyembunyikan Rotta di tempat yang tidak bisa ditemukan oleh bibi dan pamannya.
Malam harinya, kamp Djarin diserang oleh pemburu bayaran lain bernama Embo bersama hewan peliharaannya, Marrok. Mando menyembunyikan Grogu, tetapi ia kalah dalam pertarungan melawan Embo dan ditangkap. Grogu kemudian tinggal bersama empat Anzellan yang sedang memperbaiki Razor Crest, sambil mencari cara untuk menyelamatkan Djarin.
Embo membawa Djarin kembali ke Nal Hutta untuk dihadapkan kepada Hutt Twins yang murka. Mereka memaksa Embo melepas helm Djarin, sesuatu yang sangat bertentangan dengan kode Mandalorian. Mereka juga memperlihatkan bahwa Rotta sudah mereka tangkap dan siksa. Mereka bahkan berencana menyiksanya selama ratusan tahun.
Salah satu Hutt mengejek Djarin dengan mengatakan bahwa Grogu akan hidup jauh lebih lama darinya. Setelah itu, Djarin dijatuhkan ke dalam lubang berisi berbagai makhluk buas, termasuk monster raksasa bernama Dragonsnake. Mando bertarung mati-matian melawan makhluk-makhluk air itu.
Sementara itu, Grogu menyusup lewat terowongan dan akhirnya berhasil bertemu kembali dengan Djarin setelah Mando keluar dari istana Hutt.
Djarin membawa Grogu kembali ke kapal Anzellan, tetapi ia kembali diserang dan terkena racun. Ia menyuruh Grogu pergi, tetapi Grogu menolak meninggalkannya. Grogu menyembunyikan Mando dan mencari obat untuk menyembuhkannya.
Dalam pencariannya, Grogu bertemu alien nelayan bernama Gatori. Gatori menyembunyikannya dari Embo dan Marrok, lalu memberi Grogu sesuatu yang bisa menyembuhkan Djarin. Setelah Djarin pulih, ia dan Grogu memutuskan kembali untuk menyelamatkan Rotta.
Djarin dan Grogu menyusup lagi ke istana Hutt. Djarin berniat membunuh Hutt Twins karena mereka sudah melihat wajahnya. Namun Embo muncul dan menantangnya bertarung. Di saat yang sama, Grogu menggunakan Force untuk membebaskan Rotta dan menjinakkan Marrok.
Rotta kemudian melawan bibi dan pamannya. Mando berhasil mengalahkan Embo, sementara Rotta dan Hutt Twins jatuh ke lubang Dragonsnake. Grogu memakai Force untuk mengangkat Rotta keluar. Embo dan Marrok berhasil kabur, sedangkan Hutt Twins dimakan oleh Dragonsnake.
Pasukan Hutt lainnya menyerang. Namun tim bantuan yang dipimpin Ward dan para Anzellan datang untuk melawan balik. Mereka meledakkan rawa, sementara Djarin, Grogu, dan Rotta berhasil melarikan diri.
Setelah semuanya selesai, Rotta mengatakan bahwa ia ingin bekerja untuk New Republic. Zeb bahkan berkata ia punya seragam yang mungkin cocok untuk Rotta.
Mando dan Grogu kemudian naik ke Razor Crest yang sudah diperbaiki. Di akhir cerita, Mando mulai mengajari Grogu cara menerbangkan kapal.
